На главную :: Blue Gene/P

Некоторые публикации по результатам расчетов на Blue Gene/P и Polus

В данном разделе приводятся некоторые ссылки на статьи, тезисы конференций и авторефераты диссертаций, в которых отражены результаты расчетов, проведенных авторами на системе Blue Gene/P и Polus, установленной на факультете ВМК МГУ имени М. В. Ломоносова.

Статьи в рецензируемых журналах

    2020

  1. Попова Н.Н., Козлов М.В., Шубин М.В. Нейросетевой метод решения задачи мэппинга параллельных приложений // Вестник ЮУрГУ. Серия: Вычислительная математика и информатика. 2020. Т. 9, No 1. С. 36–49.

    2. 2018

  2. Akchurin I.O., Yakhutina A.I., Bochkov A.Y., Solovjova N.P., Medvedev M.G., Traven V.F. Novel push-pull fluorescent dyes – 7-(diethylamino)furo- and thieno[3,2-c]coumarins derivatives: structure, electronic spectra and TD-DFT study // Journal of Molecular Structure. – 2018. – Vol. 1160. – P. 215–221. – DOI: 10.1016/j.molstruc.2018.01.086.
  3. Kruglyakov M., Kuvshinov A. Using high-order polynomial basis in 3-d em forward modelling based on volume integral equation method // Geophysical Journal International. — 2018. — Vol. 213, no. 2. — P. 1387–1401.
  4. S. M. Korotaev, N. M. Budnev, V. O. Serdyuk et al., Baikal electromagnetic experiment // Izvestiya - Atmospheric and Oceanic Physics. — 2018. — Vol. 54, no. 11. — P. 1569–1594.
  5. Чокаев Б. В., Шумкин Г. Н. Два билинейных алгоритма умножения матриц 3х3 сложности 25 // Вестник Московского университета. Серия 15: Вычислительная математика и кибернетика. — 2018. — № 1. — С. 23–31.

    6. 2017

  6. Cruchter T., Medvedev M.G., Shen X., Mietke T., Harms K., Marsch M., Meggers E. Asymmetric Nucleophilic Catalysis with an Octahedral Chiral-at-Metal Iridium(III) Complex // ACS Catalysis. – 2017. – Vol. 7, № 8. – P. 5151–5162. – DOI: 10.1021/acscatal.7b01296.
  7. Heindl C., Peresypkina E., Virovets A.V., Bushmarinov I.S., Medvedev M.G., Krämer B., Dittrich B., Scheer M. An Icosidodecahedral Supramolecule Based on Pentaphosphaferrocene: From a Disordered Average Structure to Individual Isomers // Angew. Chem. Int. Ed. – 2017. – Vol. 56, № 43. – P. 13237–13243. – DOI: 10.1002/anie.201706756.
  8. Kruglyakov M., Bloshanskaya L. High-performance parallel solver for integral equations of electromagnetics based on galerkin method // Mathematical Geosciences. — 2017. — Vol. 49, no. 6. — P. 751–776.
  9. Medvedev M.G., Bushmarinov I.S., Sun J., Perdew J.P., Lyssenko K.A. Density functional theory is straying from the path toward the exact functional // Science. – 2017. – Vol. 355, № 6320. – P. 49–52. – DOI: 10.1126/science.aah5975.
  10. Medvedev M.G., Novikov F.N., Bushmarinov I.S., Zeifman A.A., Polkovnichenko M.S., Stroganov O.V., Chilov G.G., Lyssenko K.A., Svitanko I.V. Charge redistribution in the SpnF-catalyzed Diels–Alder reaction // Mendeleev Communications. – 2017. – Vol. 27, № 5. – P. 500–502. – DOI: 10.1016/j.mencom.2017.09.024.
  11. Medvedev M.G., Panova M.V., Chilov G.G., Bushmarinov I.S., Novikov F.N., Stroganov O.V., Zeifman A.A., Svitanko I.V. Exhaustive conformational search for transition states: the case of catechol O-methyltransferase active site // Mend. Comm. – 2017. – Vol. 27. – P. 224–227. – DOI: 10.1016/j.mencom.2017.05.002.
  12. Medvedev M.G., Zeifman A.A., Novikov F.N., Bushmarinov I.S., Stroganov O.V., Titov I.Yu., Chilov G.G., Svitanko I.V. Quantifying Possible Routes for SpnF-Catalyzed Formal Diels–Alder Cycloaddition // J. Am. Chem. Soc. – 2017. – Vol. 139, № 11. – P. 3942–3945. – DOI: 10.1021/jacs.6b13243.
  13. Panova M.V., Medvedev M.G., Bushmarinov I.S., Ananyev I.V., Lyssenko K.A. Supramolecular stereoelectronic effect in hemiketals // Mendeleev Communications. – 2017. – Vol. 27. – P. 595–598. – DOI: 10.1016/j.mencom.2017.11.019.
  14. Rassolov A.V., Krivoruchenko D.S., Medvedev M.G., Mashkovsky I.S., Stakheev A.Yu., Svitanko I.V. Diphenylacetylene hydrogenation on a PdAg /Al 2 O 3 single-atom catalyst: an experimental and DFT study // Mendeleev Communications. – 2017. – Vol. 27, № 6. – P. 615–617. – DOI: 10.1016/j.mencom.2017.11.026.
  15. Traven V.F., Pozharskaya N.A., Solovjova N.P., Novikov R.A., Medvedev M.G., Chernyshev V.V., Dolotov S.M., Ivanov I.V. One-pot synthesis of new acid photogenerators for Rhodamine laser dyes fluorescence activation // Dyes and Pigments. – 2017. – Vol. 136. – P. 612–618. – DOI: 10.1016/j.dyepig.2016.09.018.

    16. 2016

  16. Ananyev I.V., Medvedev M.G., Aldoshin S.M., Eremenko I.L., Lyssenko K.A. Vibrational smearing of the electron density as function of the strength and directionality of interatomic interactions: nonvalent interactions of a nitro group within an island-type crystal [Fe(NO)2(SC6H4NO2)]2 // Russ Chem Bull. – 2016. – Vol. 65, № 6. – P. 1473–1487. – DOI: 10.1007/s11172-016-1474-0.
  17. Medvedev M.G., Bushmarinov I.S., Lyssenko K.A. Z-effect reversal in carboxylic acid associates // Chem. Commun. – 2016. – Vol. 52, № 39. – P. 6593–6596. – DOI: 10.1039/C6CC01305H.
  18. Medvedev M.G., Cherstkov V.F., Kagramanov N.D., Tyutyunov A.A., Igumnov S.M., Sterlin S.R. Thermal degradation of silver 2-hydroperfluoro-3-methylcrotonoate // Fluorine Notes. – 2016. – Vol. 3, № 106. – P. 1–1. – DOI: 10.17677/fn20714807.2016.03.04.

    19. 2015

  19. Dmitrienko A.O., Bushmarinov I.S. Reliable structural data from Rietveld refinements via restraint consistency // Journal of Applied Crystallography. – 2015. – Vol. 48, № 6. – P. 1777–1784. – DOI: 10.1107/S1600576715018233.

    20. 2010

  20. Ковалёв Д.В., Смирнов А.П., Шмелев А.Б. «Использование высокопроизводительных вычислительных систем для моделирования фарлей-бунемановской неустойчивости» // Вычислительные методы и программирование. — 2010. — Т. 11. — С. 176–183.
  21. Корж А.А. «Результаты масштабирования бенчмарка NPB UA на тысячи ядер суперкомпьютера Blue Gene/P с помощью PGAS-расширения OpenMP» // Вычислительные методы и программирование. — 2010. — Т. 11. — С. 31–41.
  22. Shumkin G.N., Popov A.M., Curioni A., Laino T. «A multiscale modelling of naphthalocyanine-based molecular switch» // Procedia Computer Science. — 2010. — Vol. 1, no. 1 — Pp. 185–192.
  23. Popov A.M., Shumkin G.N. «A multiscale molecular switch model» // Moscow University Computational Mathematics and Cybernetics. — 2010. — Vol. 34, no. 3 — Pp. 106–112.

Авторефераты диссертаций (кандидатские)

2013

  1. Семёнов А.Н. «Разработка комплекса программ решения электродинамических задач с использованием массивно-параллельных вычислительных систем»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.18

2010

  1. Ситник В.В. «Математическое моделирование распространения волновых фронтов сквозь массив растительности»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.18

2009

  1. Воронов В.Ю. «Методы разработки параллельных программ на основе машинного обучения»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.11
  2. Джосан О.В. «Исследование и разработка методов и программных средств визуализации результатов научных вычислений для массивно-параллельных вычислительных систем»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.11
  3. Ковалёв Д.В. «Численное моделирование фарлей-бунемановской неустойчивости в ионосфере Земли»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.18
  4. Позднеев А.В. «Математическое моделирование движения ионов в масс-спектрометрах»  : автореферат дис. ... кандидата физико-математических наук : 05.13.18

Тезисы конференций и материалы докладов

2020

  1. Клейменов А. А., Попова Н. Н. Статически-детерминированный метод прогнозирования динамических характеристик параллельных программ // Суперкомпьютерные дни в России : Труды международной конференции. 21–22 сентября 2020 г., Москва / Под. ред. Вл. В. Воеводина. – Москва : МАКС Пресс, 2020 — С. 109–117.

2019

  1. Попова Н. Н., Козлов М. В., Шубин М. В. Нейросетевой метод решения задачи мэппинга параллельных приложений // Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции. 23–24 сентября 2019 г., г. Москва / Под. ред. Вл.В. Воеводина. — Москва : МАКС Пресс, 2019. — С. 90–100.

2018

  1. Балыков Г. А. Parallel fdtd solver with static and dynamic load balancing // Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (24-25 сентября 2018 г., г. Москва). — Издательство МГУ Москва, 2018. — P. 410–421
  2. Чокаев Б. В., Шумкин Г. Н. ОБ ОДНОМ МЕТОДЕ ПОИСКА СИММЕТРИЧНЫХ БИЛИНЕЙНЫХ АЛГОРИТМОВ УМНОЖЕНИЯ МАТРИЦ // Дискретные модели в теории управляющих систем: Х Международная конференция, Москва и Подмосковье, 23-25 мая 2018 г. : Труды / Под ред. В. Б. Алексеев, Б. Р. Данилов, Д. С. Романов. — Т. 1 из 978-5-317-05834-0. — Москва: Москва, 2018. — С. 275–277
  3. Шубин М. В., Попова Н. Н. Метод выделения фаз в коммуникационных взаимодействиях процессов MPI-программ, Ломоносовские чтения: научная конференция, Москва, факультет ВМК МГУ имени М. В. Ломоносова, 17–26 апреля 2018 г.: тезисы докладов, с. 124.
  4. Шубин М. В., Попова Н. Н. Анализ поведения параллельных MPI-программ на основе фаз межпроцессного взаимодействия // Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (24–25 сентября 2018 г., г. Москва). – Издательство МГУ Москва, 2018. – С. 661–672.

2017

  1. Балыков Г. А. Parallel fdtd solver with optimal topology and dynamic balancing // Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (25-26 сентября 2017 г.). — Изд-во МГУ Москва, 2017. — P. 248–259.

2014

  1. G. A. Balykov, V. A. Kaloshin, A. N. Semenov, A. P. Smirnov. Electormagnetic field-focusing ebg lens // Progress in Electromagnetics Reseasch Symposium Abstracts, Guangzhou, China, August 25-28, 2014,. — Elecromagnetics Academy. 2014. — P. 400–400.

2010

  1. Джосан О.В., Попова Н.Н. «Параллельный метод сжатия изображений для визуализации данных на массивно-параллельных вычислительных системах» // Материалы международной научной конференции «Параллельные вычислительные технологии», Уфа. — 29 марта – 2 апреля 2010.
  2. Корж А.А. «Результаты масштабирования бенчмарка NPB UA на тысячи ядер суперкомпьютера Blue Gene/P с помощью PGAS-расширения OpenMP» // Материалы международной научной конференции «Параллельные вычислительные технологии», Уфа. — 29 марта – 2 апреля 2010.
  3. Воронов В.Ю. «Power Distribution Networks Simulation Using Parallel Linear Algebra Packages» // Международная суперкомпьютерная конференция «ISC'10», Гамбург, Германия. — 30 мая – 3 июня 2010.

2009

  1. Глазкова Е.А., Попова Н.Н. «Анализ эффективности гибридного параллельного программирования на примере системы Blue Gene/P» // Материалы Всероссийской научной конференции «Научный сервис в сети ИНТЕРНЕТ», Новороссийск. — 21–26 сентября 2009. — С. 36–39.
  2. Попова Н.Н., Джосан О.В., Шумкин Г.Н. «Методы визуальной поддержки для задач молекулярного моделирования на суперкомпьютере Blue Gene/P» // Материалы Всероссийской научной конференции «Научный сервис в сети ИНТЕРНЕТ», Новороссийск. — 21–26 сентября 2009. — С. 426–428.